ФГБУ «ФЦТ» располагает программными средствами, обеспечивающими подготовку и проведение ГИА-9, диагностических процедур, связанных с подготовкой к ГИА-9 и ГИА-11, с оценкой образовательных результатов школьников, с оценкой профессиональных компетенций педагогов.
Ряд программных продуктов разработан ФГБУ «ФЦТ», а программное обеспечение АИС ГИА внесено в единый реестр российских программ для электронных вычислительных машин и баз данных.